Klinická farmakologie jako nástavbový a specializační obor vnitřního lékařství provádí léčebnou činnost a péči u vybraných a zvláště komplikovaných chorob a situací.
Oddělení klinické farmakologie zajišťuje konsiliární službu a posouzení - interpretaci lékových hladin v biologickém materiálu. Jedním z nejdůležitějších úkolů je klinické hodnocení léků. Podílí se na výzkumu, vývoji a uvedení nových léků a léčebných postupů do praxe. Zajišťuje dále například hodnocení vlivu farmakologických a dalších léčebných intervencí na kvalitu života a na některé biochemické a buněčné parametry u člověka nebo sledování vlivu nutraceutických (tj. v potravinách se přirozeně vyskytujících) látek na kvalitu života a na imunitní mechanismy.